Библиотека
А.Ю. Сафронов. Компьютерные модели бионеорганических молекул (учебное пособие)
Содержание:
КАРБОКСИПЕПТИДАЗА А
Молекула размером 50*42*38 Å имеет почти сферическую форму, а около атома цинка (центр розового пятиугольника) находится полость, углубление на поверхности молекулы с несколькими молекулами Н2О или группами ОН– внутри. В присоединении Zn к молекуле белка участвуют три белковых лиганда: остатки Нis 69, Нis 196 и Glu 72, причем в связывании участвуют оба атома кислорода карбоксильной группы остатка глутаминовой кислоты. На модели показан активный центр карбоксипептидазы А в рабочей фазе (атомы азота имеют синий цвет, атомы кислорода – красный, углеродные связи – серый, атомы водорода не приведены). Пятое координационное место катиона цинка занято либо водой, либо гидроксильной группой (в отсутствие атомов водорода эти фрагменты в модели эквивалентны), а в зоне специфичности находится остаток тирозина –продукт расщепления субстрата GlуТуr.
