Библиотека
А.Ю. Сафронов. Компьютерные модели бионеорганических молекул (учебное пособие)
Содержание:
ЦИТОХРОМ С
Железосодержащий белок малой массы с одним гемом на моле-кулу и одной полипептидной цепью. Гем – комплекс железа с протопорфирином IX, связанный тиоэфирными связями с двумя остатками цистеина, Суs 14 и Суs 17. Пятое и шестое координационные места катиона железа в геме заняты имидазольной группой остатка Нis 18 и тиоэфирной группой Меt 80. Для связи с белком гем, кроме двух остатков цистеина, использует пропионатные группы порфирина. Они расположены на дне образуемой полипептидной цепью “расщелины”, в которой упакован гем, и связаны водородными связями с аминокислотными остатками белка. Благодаря этим связям, гем частично или полностью погружается в белковую молекулу и располагается в складке (“расщелине”) из полипептидных цепей, образованной шестнадцатью гидрофобными остатками аминокислот (гидрофобные группы этих остатков концентрируются преимущественно вдоль внутренней поверхности полипептидного кармана). В результате простетическая группа цитохрома с расположена так, что только край ее может контактировать с окружающей белок средой.